Aquest cardenal diaca de gran cultura, fet que li va valer el sobrenom d'«el gramàtic», va ser escollit Papa per substituir Joan XII a la seva mort. Aquesta elecció obviava el papat de Lleó VIII, protegit de l'emperador Otó I que l'havia imposat quan va deposar Joan XII el 963.
Quan va conèixer el nomenament de Benet, l'emperador Otó va tornar a Roma i, el 23 de juny del 965, va apressar el Papa Benet. Otó el va deposar al rang de diaca i el va desterrar a Hamburg; posteriorment va reposar a la càtedra de Sant Pere al seu protegit Lleó.
Fragment del monument funerari de Benet V.
Benet va morir el 4 de juliol del 966, en el seu exili d'Hamburg, on es trobava sota la custòdia d'Adaldag, l'arquebisbe de Bremen-Hamburg. Fou enterrat en la catedral d'Hamburg, tot i que les seves restes van ser traslladades a Roma sota el regnat d'Otó III.
