해군항공본부(일본어: 海軍航空本部 가이군코쿠혼부[*], 영어: Navy Aviation Bureau)는 일본 제국해군성의 외국으로, 일본 제국 해군 항공대에서 쓰는 군용기에 관련된 병기의 연구, 계획, 심사, 항공대원의 교육을 관할하였다. 기관장인 본부장은 해군중장을 임명하였다.
이 기관은 1919년에 해군함정본부 제6부 항공부로 시작하여, 1927년 4월 4일에 발표된 칙령 제61호에 따라 다음날 4월 5일에 해군성의 독립된 외국이 되었다. 그리고 종전 이후, 해군성과 다른 외, 내국과 함께 1945년 11월 1일에 폐지되었다.
부서
총무부; 1927년 4월 4일
교육부; 1927년 4월 4일
기술부; 1927년 4월 4일 ~ 1942년 11월 1일, 제2, 3, 4부로 분야별로 분리됨.
보급부; 1927년 4월 4일 ~ 1942년 11월 1일, 제1부로 개명됨.
제1부
제2부 - 기술부의 기체 설계, 개발 부문 분리. 1945년 3월 1일, 발동기 부문 추가.
제3부 - 기술부의 발동기 설계, 개발 부문 분리. 1945년 3월 1일, 발동기 부문을 제1부로 넘김.
제4부 - 기술부의 발착기, 계측기기 설계 개발 부문 분리. 1945년 3월 1일, 뇌격병기 부문으로 조정됨.
