马来西亚联邦法院（英語：Federal Court of Malaysia；馬來語：Mahkamah Persekutuan Malaysia）是马来西亚的终审法院，位于布城联邦直辖区的布城司法宫。联邦法院于1957年马来亚联合邦独立后成立，最早的历史可追溯到1826年，于1994年正式被称为「联邦法院」。
马来西亚联邦法院最早的前身是威尔斯王子岛（现槟城），新加坡和马六甲的司法院（Court of Judicature），依据由英国官方于1826年11月27日通过英王制诰所颁布的「第二次司法宪章」而设。[3]该司法院由海峡殖民地总督和市镇委员会所主持，另一名法官则被称为「记录法官」（Recorder）。1855年8月12日的「第三次司法宪章」对该法院进行了重组，从此该法院拥有两位「记录法官」。[4]
1867年4月1日，海峡殖民地成为英国君主的直辖殖民地后，[5]司法法院也正式更名为「海峡殖民地最高法院」（Supreme Court of the Straits Settlements），而总督和市镇委员会也不再是该法院的法官。[6]
第二次世界大战结束后，英国恢复了战前在马来亚的所有法院。当海峡殖民地于1946年解散时，司法制度没有发生任何的变化。由于新加坡成为直辖殖民地和马来亚联合邦的成立，[12]海峡殖民地最高法院自此被更名为「新加坡最高法院」。[13]槟城和马六甲的法院则与马来亚其他地区的法院合并组建「马来亚联合邦最高法院」（Supreme Court of the Federation of Malaya）。
独立建国
自1957年马来亚联合邦独立后，英殖民所留下来的司法与法院制度就一直被保留下来直到马来亚联合邦，沙巴，砂拉越和新加坡于1963年组建马来西亚联邦后，马来亚联合邦最高法院更名为「马来西亚联邦法院」（Federal Court of Malaysia）。1963年起，马来西亚的司法权归于马来西亚联邦法院、马来亚高等法院、婆罗洲高等法院（现为沙巴和砂拉越高等法院）和新加坡高等法院（该法院取代了殖民时期的新加坡最高法院）所有。[14]而新加坡高等法院所作出的裁决可在位于吉隆坡的马来西亚联邦法院提起上诉，然后再向英国枢密院提起上诉。
然而，新加坡与马来西亚的司法合并并没有持续下去，这是因为在1965年，马来西亚第一任首相东姑阿都拉曼在马来西亚国会通过紧急动议将新加坡州逐出马来西亚联邦。同年8月9日，新加坡独立建国。然而新加坡被逐出马来西亚联邦后的往后四年内，新加坡高等法院仍然是马来西亚联邦法院结构的一部分，新加坡高等法院所作出的裁决依然可在马来西亚联邦法院进行上诉。直到1969年，新加坡国会颁布了《1969年最高法院司法法令》（Supreme Court of Judicature Act 1969）[15]来规范新加坡的司法系统。自此，新加坡高等法院不再隶属于马来西亚联邦法院。
1988年马来西亚司法危机是指一系列发生在马来西亚的宪政危机，其可追溯到1987年巫统（UMNO）的党选开始，直到最高法院主席（Lord President of the Supreme Court）沙列阿巴斯（英语：Salleh Abas）以及2位最高法院大法官被革除职务为止。马来西亚联邦政府依据《马来西亚联邦宪法》奉行三权分立制度，而最高法院作为司法的最高机构，在1988年司法危机前相当独立，其运作完全不受行政机构以及立法机构的干扰。普遍上被人们认为是司法机构独立终结的时代是在马来西亚时任首相马哈迪·莫哈末于1988年5月革除最高法院主席沙列阿巴斯的职务后开始。此次事件也导致了马来西亚的司法独立被削弱。[17]
^Mavis Chionh. The Development of the Court System. Kevin Y[ew] L[ee] Tan (编). Essays in Singapore Legal History. Singapore: Singapore Academy of Law; Marshall Cavendish Academic. 2005: 93–138 at 99–100. ISBN 978-981-210-389-5. (hbk.), (pbk.)..
^These changes were respectively effected by the Judicial Duties Act (No. 3 of 1867) (Straits Settlements) and the Supreme Court Ordinance 1868 (No. 5 of 1868) (Straits Settlements).
^By the Courts Ordinance 1878 (No. 3 of 1878) (Straits Settlements).
^The change was effected by the Courts of Judicature Act 1963 (No. 7 of 1964, Malaysia), reprinted as Act No. RS(A) 6 of 1966 in the Singapore Reprints Supplement (Acts) of the Government Gazette.
^Supreme Court of Judicature Act 1969 (No. 24 of 1969), now the Supreme Court of Judicature Act (Cap. 322, 2007 Rev. Ed.).
^Judges of the Federal Court. Official Website of the Judicial Appointment Commission. Judicial Appointment Commission of Malaysia. [17 December 2016]. （原始内容存档于2019-09-02）.
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