Niko Eeckhout (Izegem, 16 de desembre de 1970) és un ciclista belga, professional des del 1993 al 2013.
En el seu palmarès hi ha una cinquantena de victòries, destacant nombroses clàssiques belgues i, sobretot, el Campionat de Bèlgica de ciclisme en ruta de 2006.