SFTPC

SFTPC
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2YAD

Identifikatori
AliasiSFTPC
Vanjski ID-jeviOMIM: 178620 MGI: 109517 HomoloGene: 2271 GeneCards: SFTPC
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 8 (čovjek)
Hrom.Hromosom 8 (čovjek)[1]
Hromosom 8 (čovjek)
Genomska lokacija za SFTPC
Genomska lokacija za SFTPC
Bend8p21.3Početak22,156,913 bp[1]
Kraj22,164,479 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 14 (miš)
Hrom.Hromosom 14 (miš)[2]
Hromosom 14 (miš)
Genomska lokacija za SFTPC
Genomska lokacija za SFTPC
Bend14 D2|14 36.32 cMPočetak70,758,389 bp[2]
Kraj70,761,521 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije




Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje identičnih proteina
Ćelijska komponenta extracellular region
clathrin-coated endocytic vesicle
lamellar granule
endoplasmic reticulum membrane
multivesicular body lumen
Vanćelijsko
Biološki proces respiratory gaseous exchange by respiratory system
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)
NM_001172357
NM_001172410
NM_003018
NM_001317778
NM_001317779

NM_001317780

NM_011359

RefSeq (bjelančevina)
NP_001165828
NP_001165881
NP_001304707
NP_001304708
NP_001304709

NP_003009

NP_035489

Lokacija (UCSC)Chr 8: 22.16 – 22.16 MbChr 14: 70.76 – 70.76 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Surfaktantni protein C (SP-C) jedan je od plućnih surfaktantnih proteina. To je membranski protein koji je kod ljudi kodiran genom SFTPC.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 197 aminokiselina, а molekulska težina 21.053 Da.[8]

1020304050
MDVGSKEVLMESPPDYSAAPRGRFGIPCCPVHLKRLLIVVVVVVLIVVVI
VGALLMGLHMSQKHTEMVLEMSIGAPEAQQRLALSEHLVTTATFSIGSTG
LVVYDYQQLLIAYKPAPGTCCYIMKIAPESIPSLEALNRKVHNFQMECSL
QAKPAVPTSKLGQAEGRDAGSAPSGGDPAFLGMAVNTLCGEVPLYYI

Struktura

N-terminalni propeptidni surfaktantni protein C
Svinjski SP-C koji korespondira sa ljudskim zrelim oblikom
Identifikatori
SimbolSP_C-Propep

SFTPC 197-aminokiselinski protein sastavljen od dvije polovine: jedinstvenog N-terminalnog propeptidnog domena i C-terminalnog BRICHOS domena. Propeptidni domen dužine oko 100 aa zapravo ne sadrži samo cijepani dio, već i zreli peptid. Može se dalje razgraditi na 23-aminokiselinski spiralni transmembranski propeptid, zreli izlučeni SP-C (24-58) i linker (59-89) koji se povezuje s domenom BRICHOS.[9]

Propeptid plućnog surfaktanta C ima N-terminalni alfa-heliksni segment čija je predložena funkcija bila stabilizacija proteinske strukture, budući da se zreli peptid može nepovratno transformirati iz svoje nativne alfa-heliksne strukture u agregate beta-listova i formirati amiloidna vlakna. Također je prijavljeno da tačan unutarćelijski promet proSP-C zavisi od propeptida.[10]

Struktura BRICHOS domena je riješena. Mutacije u ovom domenu također dovode do amiloidnih vlakana sačinjenih od zrelog peptida, što ukazuje na šaperonsku aktivnost.[9]

Klinički značaj

Mutacije su povezane s disfunkcijom metabolizma surfaktanta tip 2.

Ljudi i životinje rođeni bez SP-C imaju tendenciju razvoja progresivne intersticijske bolesti pluća.

Rekombinantni SP-C koristi se u Venticuteu, vještačkom surfaktantu za pluća.

Opisan je postupak masovne proizvodnje analoga zvanog rSP-C33Le, fuzijom sa spidroinom.[11]

Reference

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000168484 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022097 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Keller A, Eistetter HR, Voss T, Schäfer KP (juli 1991). "The pulmonary surfactant protein C (SP-C) precursor is a type II transmembrane protein". The Biochemical Journal. 277 ( Pt 2) (Pt 2): 493–9. doi:10.1042/bj2770493. PMC 1151261. PMID 1859376.
  6. ^ Johansson H, Nordling K, Weaver TE, Johansson J (juli 2006). "The Brichos domain-containing C-terminal part of pro-surfactant protein C binds to an unfolded poly-val transmembrane segment". The Journal of Biological Chemistry. 281 (30): 21032–9. doi:10.1074/jbc.M603001200. PMID 16709565.
  7. ^ "Entrez Gene: SFTPC surfactant, pulmonary-associated protein C".
  8. ^ "UniProt, P11686" (jezik: engleski). Pristupljeno 21. 9. 2021.
  9. ^ a b Willander H, Askarieh G, Landreh M, Westermark P, Nordling K, Keränen H, et al. (februar 2012). "High-resolution structure of a BRICHOS domain and its implications for anti-amyloid chaperone activity on lung surfactant protein C". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (7): 2325–9. Bibcode:2012PNAS..109.2325W. doi:10.1073/pnas.1114740109. PMC 3289314. PMID 22308375.
  10. ^ Li J, Liepinsh E, Almlén A, Thyberg J, Curstedt T, Jörnvall H, Johansson J (mart 2006). "Structure and influence on stability and activity of the N-terminal propeptide part of lung surfactant protein C". The FEBS Journal. 273 (5): 926–35. doi:10.1111/j.1742-4658.2006.05124.x. PMID 16478467. S2CID 1231483.
  11. ^ Kronqvist N, Sarr M, Lindqvist A, Nordling K, Otikovs M, Venturi L, et al. (maj 2017). "Efficient protein production inspired by how spiders make silk". Nature Communications. 8 (1): 15504. Bibcode:2017NatCo...815504K. doi:10.1038/ncomms15504. PMC 5457526. PMID 28534479.

Dopunska literatura

Vanjski linkovi

Ovaj članak uključuje tekst iz javnog domena Pfam i InterPro: IPR015091

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.