LIN28B

LIN28B
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

4A4I

Identifikatori
AliasiLIN28B
Vanjski ID-jeviOMIM: 611044 MGI: 3584032 HomoloGene: 47607 GeneCards: LIN28B
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za LIN28B
Genomska lokacija za LIN28B
Bend6q16.3-q21Početak104,936,616 bp[1]
Kraj105,083,332 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 10 (miš)
Hrom.Hromosom 10 (miš)[2]
Hromosom 10 (miš)
Genomska lokacija za LIN28B
Genomska lokacija za LIN28B
Bend10|10 B2Početak45,252,716 bp[2]
Kraj45,362,491 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• vezivanje sa DNK
• vezivanje iona cinka
• GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
• vezivanje iona metala
• vezivanje sa RNK
• nucleic acid binding
Ćelijska komponenta• citoplazma
• jedro
• Jedarce
• citosol
Biološki proces• pre-miRNA processing
• miRNA catabolic process
• Utišavanje gena
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
• RNA 3'-end processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

389421

380669

Ensembl

ENSG00000187772

ENSMUSG00000063804

UniProt

Q6ZN17

Q45KJ6

RefSeq (mRNK)

NM_001004317

NM_001031772
NM_001033152

RefSeq (bjelančevina)

NP_001004317

NP_001026942

Lokacija (UCSC)Chr 6: 104.94 – 105.08 MbChr 10: 45.25 – 45.36 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Lin-28 homolog B jest protein koji je kod ljudi kodiran genom LIN28B. [5]

Aminokiselinska sekvenca

Dužina polipeptidnog lanca je 250 aminokiselina, а molekulska težina 27.084 Da.[6]

1020304050
MAEGGASKGGGEEPGKLPEPAEEESQVLRGTGHCKWFNVRMGFGFISMIN
REGSPLDIPVDVFVHQSKLFMEGFRSLKEGEPVEFTFKKSSKGLESIRVT
GPGGSPCLGSERRPKGKTLQKRKPKGDRCYNCGGLDHHAKECSLPPQPKK
CHYCQSIMHMVANCPHKNVAQPPASSQGRQEAESQPCTSTLPREVGGGHG
CTSPPFPQEARAEISERSGRSPQEASSTKSSIAPEEQSKKGPSVQKRKKT

Funkcija

Protein kodiran ovim genom pripada porodici lin-28, koju karakterizira domen hladnog šoka i para CCHC domen cinkovog prsta. Ovaj gen je visoko eksprimiran u sjemenicima, fetusnoj jetri, posteljici, te u primarnim ljudskim tumorima i linijama ćelija raka. Negativno je reguliran preko miRNK koje cilja na mjesta u 3'UTR, a prekomjerna ekspresija ovog gena u primarnim tumorima povezana je s potiskivanjem porodičn ih let-7 mikroRNK i uklanjanje depresije ciljeva let-7, što olakšava ćelijsku transformaciju.

Reference

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000187772 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000063804 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: Lin-28 homolog B". Pristupljeno 6. 3. 2016.
  6. ^ "UniProt, Q6ZN17" (jezik: engleski). Pristupljeno 8. 10. 2021.

Ovaj članak uključuje tekst iz Nacionalne medicinske biblioteke Sjedinjenih Država, koji je u javnom vlasništvu.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.