Народився в місті Кабо-Фріу, штат Ріо-де-Жанейро. Футбольну кар'єру розпочав в юнацькій команді «Кабофріенсе», після чого перебрався до молодіжної команди «Крузейро». У 2013 році став гравцем «Аудакс Ріо» (U-20), а вже наступного року переведений до дорослої команди вище вказаного клубу. У червні 2015 року перейшов до «Баїя», спочатку виступав в оренді, тренувався з першою командою, але в підсумку став одним з провідних футболістів молодіжної команди у Кубку Нордесте (U-20). Протягом 2016 року виступав в оренді за «Іпірангу» та «Флуміненсе» (Фейра)[2][3][4][5][6].
«Баїя»
На початку 2017 року, після декількох оренд по клубах з чемпіонату штату, Матеус Пейшоту повернувся до «Баїя»[3][4][7]. Дебютував за команду 1 лютого, вийшовши на заміну в нічийному (0:0) виїзному поєдинку Ліги Баїяно проти «Жакуіпенсе»[8].
«Брагантіну»
У 2017 році перебрався до «Брагантіну». За нову команду дебютував 30 липня, вийшовши на заміну в нічийному (0:0) виїзному поєдинку Серії C проти «Іпіранги»[9]. Дебютним голом за нову команду відзначився 9 вересня в переможному (3:2) поєдинку проти «Тупі»[10][11].
Став відомий 18 березня 2018 року за те, що відзначився гол, який забезпечив виїзну перемогу (3:2) над «Корінтіансом» у чвертьфіналі Ліги Паулісти[12][13][14]. Але в матчі-відповіді «Брагантіну» програв та припинив боротьбу за чемпіонство.
У 2018 році став одним з провідних гравців Серії C, протягом сезону відзначився 11 голами в 33 матчах, завдяки чому ним зацікавилися декілька бразильських клубів[15][16]. За період свого першого перебування в «Брагантіну», відзначився 12 голами в 39 матчах.
«Спорт Ресіфі»
3 вересня 2018 року було оголошено про оренду Матеуса Пейшоту в «Спорт Ресіфі» до завершення сезону[17][18][19]. Дебютував за клуб з Пернамбуку 16 вересня, вийшовши на заміну у програному (1:2) виїзному поєдинку Серії A проти «Корінтіанса»[20][21]. Його гра не завадила клубу вилетіти до Серії В у 2019 році.
У футболці «Спорт Ресіфі» провів 8 поєдинків, в яких не зумів відзначитися жодним голом.
Повернення в «Брагантіну»
Після завершення оренди в «Спорт Ресіфі» 14 грудня 2018 року стало відомо, що Матеус Пейшоту повернувся до «Брагантіну»[22]. Дебютував за нову команду 19 січня 2019 року, вийшовши у стартовому складі переможного (1:0) домашнього поєдинку Ліги Паулісти проти «Гуарані», у тому числі відзначився своїм першим голом після повернення до команди, який виявився єдиним у матчі[23][24].
Став одним із чотирьох футболістів «Брагантіну», які залишилися після початку партнерства з «Ред Булл Бразіл». Матеус Пейшото, який майже не використовувався по ходу Серії В у 2019 році, покинув лавку запасних й допоміг розв'язати проблеми тренера Антоніо Карлоса Заго в атакувальній лінії команди, навіть грав флангового нападника[25][26].
Будучи одним з провідних виконавців «Брагантіну», Матеус став одним з найкращих бомбардирів команди сезону та увійшов до складу команди, яка стала чемпіоном Серії B 2019 року[16]. Протягом свого другого періоду перебування в «Брагантіну», Матеус Пейшоту провів 41 матч та відзначився 10 голами.
«Понте-Прета»
7 серпня 2020 року оголосили про оренду Матеуса Пейшоту до «Понте-Прети» до завершення сезону[27][28][29]. Дебютував за нову команду 14 серпня, вийшовши на заміну та відзначився третім голом своєї команди в нічийному (3:3) домашньому поєдинку Серії B 2020 проти «Віторії»[30][31][32].
У футболці «Понте-Прети» провів 34 матчі та відзначився 6 голами.
«Жувентуде»
12 лютого 2021 року, згідно з планами «Ред Булл Брагантіну», офіційно оголосили про оренду Матеуса Пейксото до кінця року[33][34][35][36]. Дебютував за нову команду 1 березня, вийшовши в стартовому складі в програному (0:1) поєдинку Ліги Гаушу проти «Інтернасьйоналу»[37][38].
Дебютним голом за «Жувентуде» відзначився 16 березня, відкривши рахунок у переможному (3:0) поєдинку кубка Бразилії 2021 проти «Мурісі»[39].
«Металіст»
31 липня 2021 року уклав контракт з харківським «Металістом»[40].
