TMEM205

TMEM205
Identifikatori
AliasiTMEM205
Vanjski ID-jeviOMIM: 613771 MGI: 3045495 HomoloGene: 43895 GeneCards: TMEM205
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za TMEM205
Genomska lokacija za TMEM205
Bend19p13.2Početak11,342,776 bp[1]
Kraj11,346,518 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za TMEM205
Genomska lokacija za TMEM205
Bend9|9 A3Početak21,832,304 bp[2]
Kraj21,838,852 bp[2]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

374882

235043

Ensembl

ENSG00000105518

ENSMUSG00000040883

UniProt

Q6UW68

Q91XE8

RefSeq (mRNK)
NM_001145416
NM_033408
NM_198536
NM_001321112
NM_001321113

NM_001321114

NM_001253867
NM_001253868
NM_001253869
NM_001253870
NM_178577

RefSeq (bjelančevina)
NP_001138888
NP_001308041
NP_001308042
NP_001308043
NP_212133

NP_940938

NP_001240796
NP_001240797
NP_001240798
NP_001240799
NP_848692

Lokacija (UCSC)Chr 19: 11.34 – 11.35 MbChr 9: 21.83 – 21.84 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Transmembranski protein 205 (TMEM205) je protein koji je kod ljudi kodiran genom TMEM205.

Gen

TMEM205 nalazi se na minus lancu hromosoma 19 od baznog para 11,453.452 do 11,456.981. U neposrednoj blizini TMEM205, malo uzvodno, nalazi se CCDC159, a RAB3D je malo niže od genomske sekvence.

Protein

Ljudski homolog TMEM205 dug je 189 aminokiselina i ima molekulsku težinu od 21,2 kDa. Sadrži četiri hidrofobna spiralna domena za koje se predviđa da su transmembranski domeni.

Aminokiselinska sekvenca
Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

1020304050
MEEGGNLGGLIKMVHLLVLSGAWGMQMWVTFVSGFLLFRSLPRHTFGLVQ
SKLFPFYFHISMGCAFINLCILASQHAWAQLTFWEASQLYLLFLSLTLAT
VNARWLEPRTTAAMWALQTVEKERGLGGEVPGSHQGPDPYRQLREKDPKY
SALRQNFFRYHGLSSLCNLGCVLSNGLCLAGLALEIRSL

Ekspresija

Pokazalo se da se TMEM205 eksprimira u većim količinama u tkivima koja imaju sekretornu funkciju. Ta tkiva uključuju tkiva štitnjače, nadbubrežnih žlijezda, gušterače i mliječnih tkiva.[5] Također se pokazalo da protein ispoljava pojačanu ekspresiju u tkivu tumora, koje je postalo otporno na hemoterapijske lijekove na bazi platine.

Funkcija

Smatra se da je TMEM205 višeprolazni transmembranski protein. Pokazalo se da se u ljudskim tkivima nalazi na plazemamembrani i translocira se u jedarnu ovojnicu kad ćelije postanu otporne na cisplatin.[[5] Sadrži četiri domena za koje je TMHMM analizom predviđeno da će biti transmembranski domeni.

Homologija

TMEM205 nema poznate paraloge u ljudskom genomu. Korištenje UCSC pretraživača genoma BLA[6] prema sekvenci ljudskog proteina, utvrđeno je da je rod primata Galago najbliži čovjeku a koji sadrži paralog gena TMEM205 u svom genomu. TMEM205, međutim, ima širok raspon ortolognih sekvenci

Rod – Vrsta Uobičajeno ime Divergencija sa ljudima (milioni godina)[7] Pristup proteinu u bazi NCBI Sličnost sekvenci[8] Dužina proteina
Homo sapiens[9] Ljudi 0 AAH91472.1 100% 189
Pan troglodytes[10] Obični čimpanza 6,4 XP_003316117.1 100% 189
Pongo abelii[11] Orangutan 15,8 NP 001124814.1 99% 189
Gorilla gorilla[12] Gorila 8,8 XP_004060075.1 99% 189
Callithrix jacchus[13] Obični marmozet 43,9 XP_002761800.1 96% 189
Mus musculus[14] Miš 94,1 BAA92792764.1 88% 189
Sarcophilus harrisii[15] Tasmanijski đavo 162,6 XP_003760487.1 77% 193
Crotalus adamanteus[16] Zmija zvečarka 296 AFJ51753.1 85% 188
Xenopus[17] Kandžasta žaba 371 NP_001037942.1 68% 189

Klinički značaj

Pokazalo se da je TMEM205 uključen u rezistenciju na cisplatin. Cisplatin je hemoterapijski lijek, koji se obično koristi za liječenje solidnih malignih bolesti, kao što su karcinom, sarkom i limfom. Osim što je uključen u rezistenciju na cisplatin, sve je više dokaza da je protein također uključen u bolesti tiroiditis i prostatitis

Reference

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105518 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040883 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b Shen DW, Ma J, Okabe M, Zhang G, Xia D, Gottesman MM (novembar 2010). "Elevated expression of TMEM205, a hypothetical membrane protein, is associated with cisplatin resistance". Journal of Cellular Physiology. 225 (3): 822–8. doi:10.1002/jcp.22287. PMC 2971691. PMID 20589834.
  6. ^ Kent WJ (april 2002). "BLAT--the BLAST-like alignment tool". Genome Research. 12 (4): 656–64. doi:10.1101/gr.229202. PMC 187518. PMID 11932250.
  7. ^ "Time Tree".
  8. ^ "NCBI BLAST".
  9. ^ "NCBI Protein: AAH91472.1".
  10. ^ "NCBI Protein: XP_003316117.1".
  11. ^ "NCBI Protein: NP_001124814.1".
  12. ^ "NCBI Protein: XP_004060075.1".
  13. ^ "NCBI Protein: XP_002761800.1".
  14. ^ "NCBI Protein: BAA92792764.1".
  15. ^ "NCBI Nucleotide: XP_003760487.1".
  16. ^ "NCBI Nucleotide: AFJ51753.1".
  17. ^ "NCBI Nucleotide: NP_001037942.1".

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.