Türkiye Futbol Federasyonu 2. Lig 2008-2009 sezonu, 2. Lig'in 8. sezonudur. Sezon sonunda Yükselme Grubu'nu ilk iki sırada bitiren Bucaspor ve Mersin İdman Yurdu ile play-off şampiyonu Çanakkale Dardanel1. Lig'e yükseldiler.
Kademe Grupları
Kademe gruplarında toplam 5 grup bulunmaktadır ve gruplarda 54 takım yer almaktadır.Gruplarında birinci ve ikinci olan takımlar Yükselme Grubunu oluşturur.Gruplarda kalan 44 takım ise Klasman Gruplarını oluşturur.
Kaynak: TFF Açıklama: Mavi = İç saha takımı galibiyeti; Sarı = Beraberlik; Kırmızı = Deplasman takımı galibiyeti
Yükselme Grubu
Kademe gruplarında ilk iki sırayı alanlar bu grubu oluşturur.Yapılan maçların sonucunda birinci ve ikinci olan takımlar 1. Lig'e yükselirken 3.,4. ve 5. olan takımlar 5 Klasman grubunun birincileriyle play-off maçları oynamaya hak kazanırlar. Play-off maçları 1. Lig'e çıkan üçüncü takımı belirler.
Kaynak: TFF Sıralama kuralları: 1) Puan 2) Kendi aralarındaki maçlar 3) Gol farkı 4) Atılan gol sayısı
Klasman Grupları
Kademe gruplarında ilk iki sıraya giremeyen takımlar klasman gruplarını oluşturur. Bu gruplarda kademe gruplarında aldıkları puanlar korunur. Klasman gruplarında ilk sırayı alan takımlar Yükselme Grubu'ndan gelecek 3 takımla 1. Lig'e çıkmak için play-off maçları yaparlar. Klasman gruplarında son üç sırayı alan takımlar ise 3. Lig'e düşerler.
Kaynak: TFF Sıralama kuralları: 1) Puan 2) Kendi aralarındaki maçlar 3) Gol farkı 4) Atılan gol sayısı Notlar:
^abKendi aralarındaki maçlarda: Türk Telekom 0-0 İstanbulspor, İstanbulspor 0-1 Türk Telekom, Türk Telekom 2-2 İstanbulspor, İstanbulspor 1-0 Türk Telekom (Eşitlik var, genel gol farkına bakılır)