Han var sønn av gårdbruker og urmaker Arnt Pedersen Quikne og hustru Anne Kirksæter.[3] Hans søstersønn var stortingsmann Endre Witzøe.[4] Etter underoffiserskolen i Trondhjem i 1877 gikk han i lære som urmaker.[5] Han giftet seg i 1884 med husmannsdatteren Anna Holme fra Verdal.[6] Han drev sin urmakerforretning i Øvre Bakklandet 35, hvor familien også bodde.[7]
Kirksæter ledet avholdsbevegelsens politiske felleskomité i byen. Han var innvalgt i Trondhjem bystyre og formannskap for Edruelighetsvennene fra 1898 til 1901 og igjen fra 1904.[5][8] Kirksæter var innvalgt på Stortinget fra kjøpstedene Trondhjem og Levanger fra 1901 til 1903, valgt for Venstre, og satt i Stortingets næringskomité. Fra 1907 til 1908 møtte han fast for statsråd Magnus Halvorsen fra Bakklandet krets i Trondhjem og Levanger;[5] de var valgt i samarbeid mellom Venstre og Samlingspartiet for å demme opp for Arbeiderpartiet i kretsen.[9] Også i denne perioden satt Kirksæter i næringskomiteen.[5]