SHELX

SHELX
Тип Программное обеспечение для кристаллографии
Автор Джордж М. Шелдрик
Разработчики Джордж М. Шелдрик и др. сотрудники кафедры структурной химии Гёттингенского университета
Написана на Fortran
Операционные системы Microsoft Windows, Linux, macOS
Дата выпуска 1970[1]
Последняя версия 2025/1
Лицензия Бесплатное ПО для академического использования / Платное для коммерческого
Сайт shelx.uni-goettingen.de

SHELX — пакет программ, созданный Джорджем М. Шелдриком для определения и анализа кристаллических структур молекулярных соединений и макромолекул. Пакет обрабатывает данные, полученные методом дифракции монохроматического рентгеновского или нейтронного излучения на монокристаллах. В состав пакета входит несколько отдельных исполняемых программ, совместимых со всеми современными версиями Linux, Microsoft Windows и macOS. Использование программного обеспечения бесплатно для академических учреждений, в то время как коммерческие организации должны приобретать лицензию[3].

Значимость пакета подчёркивается тем, что одна из посвящённых ему статей занимает 5-е место в рейтинге самых цитируемых научных публикаций XXI века во всех областях науки[4].

Обзор

Отдельные программы пакета могут быть запущены из графических пользовательских интерфейсов, таких как shelXle, Olex2, Oscail или WinGX. Также возможен запуск программ из командной строки.

SHELX-2019 включает в себя следующие программы[5]:

  • SHELXT — предназначена для решения молекулярных структур[6].
  • SHELXS — содержит классические прямые методы для решения молекулярных структур.
  • SHELXL — используется для уточнения молекулярных структур[7].
  • PDB2INS — создаёт входные файлы для уточнения макромолекул с помощью SHELXL[8].
  • CIFTAB и ShredCIF — позволяют редактировать и обрабатывать файлы формата CIF.
  • SHELXC, SHELXD и SHELXE — обрабатывают структурные данные макромолекул[9].
  • AnoDe — позволяет анализировать карты электронной плотности макромолекул.

Архитектура программы

Программы написаны на языке Fortran[10]. С 2000 года разрабатываются распараллеленные версии программ для многопроцессорных систем[11][12].

Литература

  • Sheldrick, G. M. A short history of SHELX // Acta Cryst. A64 (2008) P. 112–122. doi:10.1107/S0108767307043930.
  • Müller, P., Herbst-irmer, R., Spek, A. L., Schneider, T. R. Crystal Structure Refinement: A Crystallographer's Guide to SHELXL. — (International Union of Crystallography Texts on Crystallography, Band 19). — 2006. — ISBN 978-0-19-857076-9.

Примечания

  1. ↑ Sheldrick G. M. A short history of SHELX (англ.) // Acta Crystallographica Section A: Foundations and Advances — Wiley-Blackwell, Wiley, IUCr, 2007. — Vol. 64, Iss. 1. — P. 112. — ISSN 0108-7673; 1600-5724; 2053-2733 — doi:10.1107/S0108767307043930 — PMID:18156677
  2. ↑ http://shelx.uni-goettingen.de/cif.php
  3. ↑ The SHELX homepage (англ.). Дата обращения: 21 мая 2024.
  4. ↑ Exclusive: the most-cited papers of the twenty-first century: A Nature analysis reveals the 25 highest-cited papers published this century and explores why they are breaking records. (англ.). Дата обращения: 25 апреля 2025.
  5. ↑ SHELX wikis and manuals (англ.). Дата обращения: 21 мая 2024.
  6. ↑ George M. Sheldrick. SHELXT – Integrated space-group and crystal-structure determination (англ.) // Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances. — 2015. — Vol. 71, no. 1. — P. 3–8. — doi:10.1107/S2053273314026370.
  7. ↑ George M. Sheldrick. Crystal structure refinement with SHELXL (англ.) // Acta Crystallographica Section C Structural Chemistry. — 2015. — Vol. 71, no. 1. — P. 3–8. — doi:10.1107/S2053229614024218.
  8. ↑ PDB2INS : bridging the gap between small-molecule and macromolecular refinement (англ.) // Journal of Applied Crystallography. — 2019. — Vol. 52, no. 3. — P. 669–673. — doi:10.1107/S1600576719005478.
  9. ↑ Extending molecular-replacement solutions with SHELXE (англ.) // Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography. — 2013. — Vol. 69, no. 11. — P. 2251–2256. — doi:10.1107/S0907444913027534.
  10. ↑ G. M. Sheldrick. Some algorithms used in SHELX (англ.) (PDF). Дата обращения: 21 мая 2024.
  11. ↑ G. M. Sheldrick. Programs for multiple-CPU computers (англ.) (PDF). Дата обращения: 21 мая 2024.
  12. ↑ Kay Diederichs. Computing in macromolecular crystallography using a parallel architecture (англ.) // Journal of Applied Crystallography. — 2000. — Vol. 33, no. 4. — P. 1154–1161. — doi:10.1107/S002188980000697X.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.