PRPF31
| Фактор процессирования пре-мРНК 31 | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 PDB прорисовано по 2ozb. | |||||||||||
| Доступные структуры | |||||||||||
| PDB | Поиск ортологов: PDBe, RCSB | ||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | PRPF31 ; NY-BR-99; PRP31; RP11; SNRNP61 | ||||||||||
| Внешние ID | OMIM: 606419 MGI: 1916238 HomoloGene: 5980 GeneCards: Ген PRPF31 | ||||||||||
| |||||||||||
| Ортологи | |||||||||||
| Вид | Человек | Мышь | |||||||||
| Entrez | 26121 | 68988 | |||||||||
| Ensembl | ENSG00000105618 | ENSMUSG00000008373 | |||||||||
| UniProt | Q8WWY3 | Q8CCF0 | |||||||||
| RefSeq (мРНК) | NM_015629 | NM_001159714 | |||||||||
| RefSeq (белок) | NP_056444 | NP_001153186 | |||||||||
| Локус (UCSC) | Chr 19: 54.62 – 54.64 Mb |
Chr 7: 3.63 – 3.64 Mb |
|||||||||
| Поиск в PubMed | Искать | Искать | |||||||||
PRP31 — обрабатывающий пре-мРНК фактор 31, гомолог (S. Cerevisiae [1]) (англ. «PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (S. cerevisiae)») , также известный как PRPF31 , — белок, кодируемый у человека геном PRPF31.[2]
Функция
PRPF31 — ген, кодирующий фактор сплайсинга hPRP31. Это имеет важное значение для формирования сплайсосом hPRP31 связанных с U4/U4 di-snRNP и взаимодействующих с другим фактором сплайсинга hPRP6, для формирования U4/U6- U5 tri-snRNP. Было выявлено, что когда срывается РНК-интерференция hPRP31, U4/U6 di-snPRNPs накапливаются в тельцах Кахаля и U4/U6-U5 tri-snRNP не может сформироваться. [3]
PRPF31 набирает интроны после присоединения U4 и U6 РНК и 15.5K белка NHP2L1. Добавление PRPF31 имеет решающее значение для перехода сплайсосомного комплекса в активированное состояние.[4]
Клиническое значение
Мутация в PRPF31 является одной из 4 известных мутаций факторов сплайсинга, которые, как известно, вызывают пигментный ретинит . Первая мутация в PRPF31 была обнаружена Vithana и др. в 2001 году.[2] пигментный ретинит (RP) является клинически и генетически гетерогенной группой дистрофии сетчатки, характеризующейся прогрессирующей дегенерацией фоторецепторов, что в конечном счёте, приводит к серьёзным нарушениям зрения.[5]
Наследование
Мутации в PRPF31 наследуются аутосомно-доминантным образом, что приводит к 2,5% случаев аутосомно-доминантного пигментного ретинита (adRP) в смешанном населении Великобритании. [6] Однако картина наследования мутаций PRPF31 не является типично доминантным наследованием, показывая феномен частичной пенетрантности , в результате чего доминантные мутации появляются с "пропусками" поколений. Это, как полагают, из-за наличия двух аллелей дикого типа (англ. «wild type»), высокоэкспрессивного аллеля и низкоэкспрессивного аллеля. Если пациент имеет мутантный аллель и высокоэкспрессивный аллель, то они не являют фенотип болезни. Если пациент имеет мутантный аллель и алель низкого уровня экспрессивности, остаточный уровень белка падает ниже порога для нормального функционирования, и в этом случае они являют фенотип болезни. Поэтому картину наследования PRPF31 можно рассматривать как разновидность гаплонедостаточности. Этот вариант гаплонедостаточности виден только в двух других заболеваниях человека: протопорфирия эритроцитов, вызванная мутациями в гене FECH; и наследственный овалоцитоз, вызванные мутациями в спектриновом гене. [7] [8]
Примечания
- ↑ Вероятно, Saccharomyces cerevisiae- пекарские дрожжи, имеется в виду человеческий гомолог этого грибка
- ↑ 1 2 Vithana E.N., Abu-Safieh L., Allen M.J., Carey A., Papaioannou M., Chakarova C., Al-Maghtheh M., Ebenezer N.D., Willis C., Moore A.T., Bird A.C., Hunt D.M., Bhattacharya S.S. A human homolog of yeast pre-mRNA splicing gene, PRP31, underlies autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19q13.4 (RP11) (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2001. — August (vol. 8, no. 2). — P. 375—381. — doi:10.1016/S1097-2765(01)00305-7. — PMID 11545739.
- ↑ Schaffert N., Hossbach M., Heintzmann R., Achsel T., Lührmann R. RNAi knockdown of hPrp31 leads to an accumulation of U4/U6 di-snRNPs in Cajal bodies (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2004. — August (vol. 23, no. 15). — P. 3000—3009. — doi:10.1038/sj.emboj.7600296. — PMID 15257298. — PMC 514917.
- ↑ Liu S., Li P., Dybkov O., Nottrott S., Hartmuth K., Lührmann R., Carlomagno T., Wahl M.C. Binding of the human Prp31 Nop domain to a composite RNA-protein platform in U4 snRNP (англ.) // Science : journal. — 2007. — April (vol. 316, no. 5821). — P. 115—120. — doi:10.1126/science.1137924. — PMID 17412961.
- ↑ Entrez Gene: PRPF31 PRP31 pre-mRNA processing factor 31 homolog (S. cerevisiae).
- ↑ Waseem N.H., Vaclavik V., Webster A., Jenkins S.A., Bird A.C., Bhattacharya S.S. Mutations in the gene coding for the pre-mRNA splicing factor, PRPF31, in patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science[англ.] : journal. — 2007. — March (vol. 48, no. 3). — P. 1330—1334. — doi:10.1167/iovs.06-0963. — PMID 17325180.
- ↑ Randon J., Boulanger L., Marechal J., Garbarz M., Vallier A., Ribeiro L., Tamagnini G., Dhermy D., Delaunay J. A variant of spectrin low-expression allele alpha LELY carrying a hereditary elliptocytosis mutation in codon 28 (англ.) // British Journal of Haematology[англ.] : journal. — 1994. — November (vol. 88, no. 3). — P. 534—540. — doi:10.1111/j.1365-2141.1994.tb05070.x. — PMID 7819065.
- ↑ Gouya L., Puy H., Lamoril J., Da Silva V., Grandchamp B., Nordmann Y., Deybach JC. Inheritance in erythropoietic protoporphyria: a common wild-type ferrochelatase allelic variant with low expression accounts for clinical manifestation (англ.) // American Journal of Human Genetics[англ.] : journal. — 1998. — June (vol. 93, no. 6). — P. 2150—2110. — PMID 10068685.
Литература
- Tarizzo M.L. The World Health Organization and the prevention of blindness (англ.) // Transactions. Section on Ophthalmology. American Academy of Ophthalmology and Otolaryngology : journal. — 1975. — Vol. 79, no. 3 Pt 2. — P. OP453—6. — PMID 1154573.
- al-Maghtheh M., Inglehearn C.F., Keen T.J., et al. Identification of a sixth locus for autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19 (англ.) // Human Molecular Genetics : journal. — Oxford University Press, 1994. — Vol. 3, no. 2. — P. 351—354. — doi:10.1093/hmg/3.2.351. — PMID 8004108.
- Al-Maghtheh M., Vithana E., Tarttelin E., et al. Evidence for a major retinitis pigmentosa locus on 19q13.4 (RP11) and association with a unique bimodal expressivity phenotype (англ.) // American Journal of Human Genetics[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 59, no. 4. — P. 864—871. — PMID 8808602. — PMC 1914817.
- Hartley J.L., Temple G.F., Brasch M.A. DNA Cloning Using In Vitro Site-Specific Recombination (англ.) // Genome Research : journal. — 2001. — Vol. 10, no. 11. — P. 1788—1795. — doi:10.1101/gr.143000. — PMID 11076863. — PMC 310948.
- Wiemann S., Weil B., Wellenreuther R., et al. Toward a Catalog of Human Genes and Proteins: Sequencing and Analysis of 500 Novel Complete Protein Coding Human cDNAs (англ.) // Genome Research : journal. — 2001. — Vol. 11, no. 3. — P. 422—435. — doi:10.1101/gr.GR1547R. — PMID 11230166. — PMC 311072.
- Simpson J.C., Wellenreuther R., Poustka A., et al. Systematic subcellular localization of novel proteins identified by large-scale cDNA sequencing (англ.) // EMBO Reports[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 1, no. 3. — P. 287—292. — doi:10.1093/embo-reports/kvd058. — PMID 11256614. — PMC 1083732.
- Vithana E.N., Abu-Safieh L., Allen M.J., et al. A human homolog of yeast pre-mRNA splicing gene, PRP31, underlies autosomal dominant retinitis pigmentosa on chromosome 19q13.4 (RP11) (англ.) // Molecular Cell[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 8, no. 2. — P. 375—381. — doi:10.1016/S1097-2765(01)00305-7. — PMID 11545739.
- Makarova O.V., Makarov E.M., Liu S., et al. Protein 61K, encoded by a gene (PRPF31) linked to autosomal dominant retinitis pigmentosa, is required for U4/U6·U5 tri-snRNP formation and pre-mRNA splicing (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2002. — Vol. 21, no. 5. — P. 1148—1157. — doi:10.1093/emboj/21.5.1148. — PMID 11867543. — PMC 125353.
- Deery E.C., Vithana E.N., Newbold R.J., et al. Disease mechanism for retinitis pigmentosa (RP11) caused by mutations in the splicing factor gene PRPF31 (англ.) // Human Molecular Genetics : journal. — Oxford University Press, 2003. — Vol. 11, no. 25. — P. 3209—3219. — doi:10.1093/hmg/11.25.3209. — PMID 12444105.
- Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H., et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
- Martínez-Gimeno M., Gamundi M.J., Hernan I., et al. Mutations in the pre-mRNA splicing-factor genes PRPF3, PRPF8, and PRPF31 in Spanish families with autosomal dominant retinitis pigmentosa (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 44, no. 5. — P. 2171—2177. — doi:10.1167/iovs.02-0871. — PMID 12714658.
- Scanlan M.J., Gout I., Gordon C.M., et al. Humoral immunity to human breast cancer: antigen definition and quantitative analysis of mRNA expression (англ.) // Cancer Immun. : journal. — 2003. — Vol. 1. — P. 4. — PMID 12747765.
- Wang L., Ribaudo M., Zhao K., et al. Novel Deletion in the Pre-mRNA Splicing Gene PRPF31 Causes Autosomal Dominant Retinitis Pigmentosa in a Large Chinese Family (англ.) // American Journal of Medical Genetics[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 121, no. 3. — P. 235—239. — doi:10.1002/ajmg.a.20224. — PMID 12923864. — PMC 1579744.
- Reuter T.Y., Medhurst A.L., Waisfisz Q., et al. Yeast two-hybrid screens imply involvement of Fanconi anemia proteins in transcription regulation, cell signaling, oxidative metabolism, and cellular transport (англ.) // Experimental Cell Research[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 289, no. 2. — P. 211—221. — doi:10.1016/S0014-4827(03)00261-1. — PMID 14499622.
- Vithana E.N., Abu-Safieh L., Pelosini L., et al. Expression of PRPF31 mRNA in patients with autosomal dominant retinitis pigmentosa: a molecular clue for incomplete penetrance? (англ.) // Investigative Ophthalmology & Visual Science[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 44, no. 10. — P. 4204—4209. — doi:10.1167/iovs.03-0253. — PMID 14507862.
- Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T., et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
- Grimwood J., Gordon L.A., Olsen A., et al. The DNA sequence and biology of human chromosome 19 (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 428, no. 6982. — P. 529—535. — doi:10.1038/nature02399. — PMID 15057824.
- Xia K., Zheng D., Pan Q., et al. A novel PRPF31 splice-site mutation in a Chinese family with autosomal dominant retinitis pigmentosa (англ.) // Molecular Vision[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 10. — P. 361—365. — PMID 15162096.
- Schaffert N., Hossbach M., Heintzmann R., et al. RNAi knockdown of hPrp31 leads to an accumulation of U4/U6 di-snRNPs in Cajal bodies (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 2005. — Vol. 23, no. 15. — P. 3000—3009. — doi:10.1038/sj.emboj.7600296. — PMID 15257298. — PMC 514917.
- Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A., et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Посттранскрипционные модификации | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Ядерные  |
| ||||||||
Цитозольные  | |||||||||
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.