Docking@Home
| Docking@Home | |
|---|---|
 | |
 Графика из программы-клиента | |
| Тип | Распределённые вычисления |
| Операционная система | Кроссплатформенное ПО |
| Аппаратная платформа | x86 |
| Последняя версия | • Charmm 34a2: 6.23 |
| Состояние | Закрытие 23.05.2014 |
| Сайт | docking.cis.udel.edu |
 Медиафайлы на Викискладе | |
| Docking@Home | |
|---|---|
 | |
| Платформа | BOINC |
| Объём загружаемого ПО | 7.7 МБ |
| Объём загружаемых данных задания | 1.2 МБ |
| Объём отправляемых данных задания | 75—100 КБ |
| Объём места на диске | 11 МБ |
| Используемый объём памяти | 169 МБ |
| Графический интерфейс | есть |
| Среднее время расчёта задания | 5.5 часов |
| Deadline | 14 дней |
| Возможность использования GPU | нет |
| Медиафайлы на Викискладе | |
Docking@Home — проект добровольных вычислений, работающий на платформе BOINC. Проект организован университетом Делавэра. Основной задачей проекта является моделирование взаимодействия потенциальных лекарственных средств с белками (докинг).[1] 7 апреля руководство Docking@Home объявило о закрытии проекта, состоявшегося 23 мая 2014 года.[2]
Докинг
Молекулярный докинг представляет собой поиск лиганд-белковых комплексов, имеющих минимальную свободную энергию, то есть таких, компоненты которых оптимальным образом «подходят» друг к другу. Поиск таких комплексов — задача, которая хорошо распараллеливается, и поэтому подходит для распредёленных вычислений.[3] В проекте Docking@Home моделирование связывания лиганда с сайтом связывания белка проводится при помощи программного модуля CHARMM. Процесс состоит из нескольких независимых попыток с различной пространственной ориентацией и конформацией лиганда.[1]
Детали проекта и статистика
Научные достижения
Примечания
- ↑ 1 2 http://ieeexplore.ieee.org/xpl/freeabs_all.jsp?arnumber=4228396 Архивная копия от 27 марта 2014 на Wayback Machine pdf Архивная копия от 10 июня 2010 на Wayback Machine
- ↑ Новость о закрытии проекта Архивировано 17 октября 2014 года.
- ↑ Stephen Childs; Luc Bouge; Martti Forsell; Träff, Jesper; Achim Streit; Ziegler, Wolfgang; Alexander, Michael Van Cleave. Euro-Par 2007 Workshops: Parallel Processing: HPPC 2007, UNICORE Summit 2007, and VHPC 2007, Rennes, France, August 28-31, 2007, Revised Selected Papers (Lecture Notes in Computer Science) (англ.). — Berlin: Springer, 2008. — P. 85. — ISBN 3-540-78472-1.
См. также
Ссылки
.svg){kind=small}
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.