Jmol

Jmol
DesenvolvedorJmol development team
Repositório
Escrito emJava
Sistema
operacional		Cross-platform
Disponível emCatalan, Czech, Dutch, English, Estonian, French, German, Portuguese, Spanish, Turkish
TipoMolecular modelling
LicençaLGPL
Websitewww.jmol.org and wiki.jmol.org

Jmol é um visualizador open-source em Java de estruturas químicas em 3D. O Jmol se volta como uma ferramenta de representação, em 3D, de uma molécula, que pode ser utilizado como uma ferramenta de ensino[1], por exemplo, ou para pesquisas em química e bioquímica. É um software livre e aberto, escrito em Java e por isso, o software roda em Windows, Mac OS X, Linux e Unix. Existe uma aplicação autônoma e um kit de ferramentas de desenvolvimento que podem ser integrados em outras aplicações Java. A característica mais notável é um applet que pode ser integrado em páginas da Web para exibir as moléculas em uma variedade de maneiras. Por exemplo, as moléculas podem ser exibidos como modelos de "bastão e bola", por enchimento, por fita e etc. Jmol suporta uma ampla gama de formatos de arquivos moleculars, incluindo o formato Protein Data Bank (PDB), Crystallographic Information File (CIF), MDL Molfile (mol), e Chemical Markup Language (CML).

O Jmol applet, entre outros recursos, oferece uma alternativa para o plug-in Chime[1], que não se encontra mais em desenvolvimento. Enquanto o Jmol tem muitas características que não estão disponíveis no Chime, não tem a pretensão de reproduzir todas as funcionalidades Chime (sobretudo, o modo alerta de escultura). Chime requer um plug-in de instalação e os seguintes navegadores: Internet Explorer 6.0 ou Firefox 2.0 no Microsoft Windows, ou OS 9/Netscape Communicator 4,8 no Macintosh.O Jmol necessita de instalação Java e opera em uma ampla variedade de plataformas. Por exemplo, Jmol é totalmente funcional no Mozilla Firefox, Internet Explorer, Opera e Google Chrome no Microsoft Windows, no Mozilla Firefox em Linux, e no Safari no Mac OS X.

Fotos

Referências

  1. ↑ a b Herraez, A (2006), «Biomolecules in the Computer: Jmol to the Rescue», Biochemistry and Molecular Biology Education, 34 (4), doi:10.1002/bmb.2006.494034042644 

Ligações externas

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