CHARMM

CHARMM
Basisdaten

Entwickler Martin Karplus, Accelrys
Erscheinungsjahr 1983
Aktuelle Version 45[1]
(12. Juli 2024)
Betriebssystem Unix
Programmier­sprache Fortran
Kategorie Simulationssoftware
Lizenz kommerziell (600 US-$ für Akademiker)
deutschsprachig nein
www.charmm.org

CHARMM (Chemistry at Harvard Macromolecular Mechanics) ist ein Programm für molekulardynamische Berechnungen von (biologischen) Makromolekülen wie Proteinen und DNA. Weiterhin wird CHARMM mit einer Reihe von Kraftfeldern in Verbindung gebracht. Die Software selbst wird von der chemischen Fakultät der Harvard University gepflegt und weltweit in verschiedenen Arbeitsgruppen unter Nutzung von Fortran weiterentwickelt.

CHARMM-Kraftfeld

Das CHARMM-Kraftfeld ist neben den AMBER- und GROMACS-Kraftfeldern eines der am meisten verwendeten und wird von einer Reihe weiterer Programme wie beispielsweise NAMD unterstützt. Während das Simulationsprogramm an der Harvard University gepflegt wird, wird das Kraftfeld in der Gruppe von Alexander MacKerell an der University of Maryland weiterentwickelt. Die Kraftfelder werden kostenlos zum Download bereitgestellt.

Einzelnachweise

  1. ↑ Steven L. Austin, Joshua Buckner, Hao-Ting Chang, Mehdi Bagerhi Hamaneh, Silvan Käser, Nathan R. Kern, Dan T. Major, Amanda R. Pittman, Thenmalarchelvi Rathinavelan, Kai Töpfer, Luis Itza Vazquez-Salazar, Richard M. Venable, Luke C. Warrensford, H. Lee Woodcock, Yujin Wu: CHARMM at 45: Enhancements in Accessibility, Functionality, and Speed. In: The Journal of Physical Chemistry B. 20. September 2024, S. 9976–10042.

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