Gubitak (delecija) hromosomske regije 13q14 česta je citogenetička promjena u hroničnoj limfocitnoj leukemiji B-ćelija (BCLL), što ukazuje na prisutnost navodnog gena za supresiju tumora na ovom mjestu. Izgradnjom detaljne restrikcijske i transkripcijske mape minimalno deletirane regije od 130 kb, skriningom panela primarnih klonova BCLL, pretraživanjem baze podataka EST i mapiranjem delecije, Liu et al (1997) identificirali su dvas gena, DLEU1 i DLEU2, koje su nazvali Leu1 i Leu2, u minimalno deletiranom području od 10 kb. Gen DLEU2 kodira predviđeni protein sa 84 aminokiseline. Northern blot analiza otkrila je snažnu ekspresiju transkripata od 1,4 i 1,8 kb samo u timusu i sjemenicima.[5]
Corcoran et al. (2004) identificirali su više DLEU2 transkripata proizvedenih preskakanjem egzona, uključivanjem introna i upotrebom alternativnih internih mjesta donora ili prihvata prerade. PCR analiza otkrila je tkivno specifičnu ekspresiju nekoliko varijanti prerađenog DLEU2, a većina tkiva eksprimirala je više varijanti. Gen RFP2 (TRIM13) preklapa DLEU2 u antisens orijentaciji i kod miševa i kod ljudi, a in situ hibridizacija embriona miša otkrila je koekspresiju Dleu2 sa Rfp2 u svim ispitivanim tkivima. Otkrili su da RFP2 kodira navodni bicistronski transkript koji sadrži ORF za RFP2 i DLTET (KCNRG), kao i monocistronske transkripte. Nukleotidne sekvence mišjih i ljudskih DLEU2 cDNK su visoko konzervirane, ali ne i pretpostavljeni ORF-ovi, što sugerira da DLEU2 može biti nekodirajuća RNK koja regulira ekspresiju RFP2.
Struktura gena
Liu et al. (1997.) utvrdili su da DLEU2 genu nedostaje TATA-kutija, ali ima nekoliko potencijalnih cis-djelujućih elemenata DNK.
Corcoran et al. (2004) utvrdili su da gen DLEU2 obuhvata 143 kb i sadrži 15 egzona, uključujući dva alternativna prva egzona (1A i 1B). Pretpostavljeni bicistronski gen RFP2/DLTET nalazi se između egzona 10 i 12 DLEU2 u antisenskoj orijentaciji. Svi RFON2 i DLTET egzoni potiču od DLEU2 introna, osim RFP2 egzona 1A, koji se direktno preklapa sa DLEU2 egzonom 11. Intron između DLEU2 egzona 1A i 1B sadrži prva četiri egzona DLEU1, koji se transkribira u suprotnoj orijentaciji u DLEU2. DLEU2 intron 6 sadrži dva gena mikroRNK, MIRN15A i MIRN16-1.[6]
Mapiranje
Liu et al (1997) mapirali su gen DLEU2 u hromosomskoj regiji 13q14.
Corcoran et al. (2004) mapirali su mišji gen Dleu2 u područje hromosoma 14 koje dijeli homologiju sinteze s ljudskim hromosomom 13q14.3.
Molekulska genetika
Liu et al. (1997.) nisu uspjeli otkriti nikakve intragenske ili tačkaste mutacije u DLEU1 i DLEU2 u 170 uzoraka CLL. Međutim, prvi egzon svakog gena bio je deletiran u svim ispitivanim slučajevima gelecije 13q14.
^"Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ abLiu Y, Corcoran M, Rasool O, Ivanova G, Ibbotson R, Grandér D, Iyengar A, Baranova A, Kashuba V, Merup M, Wu X, Gardiner A, Mullenbach R, Poltaraus A, Hultström AL, Juliusson G, Chapman R, Tiller M, Cotter F, Gahrton G, Yankovsky N, Zabarovsky E, Einhorn S, Oscier D (Nov 1997). "Cloning of two candidate tumor suppressor genes within a 10 kb region on chromosome 13q14, frequently deleted in chronic lymphocytic leukemia". Oncogene. 15 (20): 2463–2473. doi:10.1038/sj.onc.1201643. PMID9395242. S2CID21133945.
^Liu, Y., Corcoran, M., Rasool, O., Ivanova, G., Ibbotson, R., Grander, D., Iyengar, A., Baranova, A., Kashuba, V., Merup, M., Wu, X., Gardiner, A., and 12 others. Cloning of two candidate tumor suppressor genes within a 10 kb region on chromosome 13q14, frequently deleted in chronic lymphocytic leukemia. Oncogene 15: 2463-2473, 1997. PubMed: 9395242
^Corcoran, M. M., Hammarsund, M., Zhu, C., Lerner, M., Kapanadze, B., Wilson, B., Larsson, C., Forsberg, L., Ibbotson, R. E., Einhorn, S., Oscier, D. G., Grander, D., Sangfelt, O. DLEU2 encodes an antisense RNA for the putative bicistronic RFP2/LEU5 gene in humans and mouse. Genes Chromosomes Cancer 40: 285-297, 2004. PubMed: 15188451
Dopunska literatura
Kapanadze B, Makeeva N, Corcoran M, Jareborg N, Hammarsund M, Baranova A, Zabarovsky E, Vorontsova O, Merup M, Gahrton G, Jansson M, Yankovsky N, Einhorn S, Oscier D, Grandér D, Sangfelt O (Dec 2000). "Comparative sequence analysis of a region on human chromosome 13q14, frequently deleted in B-cell chronic lymphocytic leukemia, and its homologous region on mouse chromosome 14". Genomics. 70 (3): 327–334. doi:10.1006/geno.2000.6386. PMID11161783.
Baranova A, Hammarsund M, Ivanov D, Skoblov M, Sangfelt O, Corcoran M, Borodina T, Makeeva N, Pestova A, Tyazhelova T, Nazarenko S, Gorreta F, Alsheddi T, Schlauch K, Nikitin E, Kapanadze B, Shagin D, Poltaraus A, Ivanovich Vorobiev A, Zabarovsky E, Lukianov S, Chandhoke V, Ibbotson R, Oscier D, Einhorn S, Grander D, Yankovsky N (Dec 2003). "Distinct organization of the candidate tumor suppressor gene RFP2 in human and mouse: multiple mRNA isoforms in both species- and human-specific antisense transcript RFP2OS". Gene. 321: 103–112. doi:10.1016/j.gene.2003.08.007. PMID14636997.
Corcoran MM, Hammarsund M, Zhu C, Lerner M, Kapanadze B, Wilson B, Larsson C, Forsberg L, Ibbotson RE, Einhorn S, Oscier DG, Grandér D, Sangfelt O (Aug 2004). "DLEU2 encodes an antisense RNA for the putative bicistronic RFP2/LEU5 gene in humans and mouse". Genes, Chromosomes & Cancer. 40 (4): 285–297. doi:10.1002/gcc.20046. PMID15188451.
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.