CFAP157

CFAP157
Identifikatori
Aliasi
Vanjski ID-jeviGeneCards: [1]
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

n/a

n/a

Ensembl

n/a

n/a

UniProt

n
a

n/a

RefSeq (mRNK)

n/a

n/a

RefSeq (bjelančevina)

n/a

n/a

Lokacija (UCSC)n/an/a
PubMed pretragan/an/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Protein 157 pridružen cilijama i flagelama (CFAP157), znan i kao otvoreni okvir čitanja 117 hromosoma 9 (c9orf117) jest protein loji je kod ljudi kodiran genomt CFAP157 .

Prema UniProt-u, gen CFAP157 je "specifično potreban tokom spermatogeneze za morfogenezu flagela i pokretljivost sperme, a može biti potreban i za suzbijanje stvaranja prekobrojnih aksonema i osiguravanje ispravne ultrastrukture".[1]

Gen

Lokacija

CFAP157 se kod ljudi nalazi na hromosomu 9, sekvenca 9q34.11 od baznog para 127.706.989 do baZNOG PARA 127.716.002.[2]

Lokacija CFAP157 na hromosomu 9

Obilježja

Veličina gena je 9.013 baza, a orijentacija je plus lanac.[2] Gen sadrži 9 egzona.[3]

iRNK

Najčešća varijanta iRNK CFAP157 sadrži 1.722 parova baza.[3]

Ekspresija

CFAP157 se eksprimira u mnogim tkivima ljudskog tijela, kao što su grlić maternice, pluća, sjemenici i materica. Žeme koje imaju tumor maternice vjerovatno imaju ekspresiju u CFAP157. Ovaj gen je ehsprimiran je i kod odraslih i kod fetusa.[4]

Protein

Kod čovjeka, u CFAP157 ima 520 aminokiselina.[5] Protein je izuzetno bogat glutaminom, a siromašan glicinom. Prilično je neutralan sa izoelektrična tačka pri pH 7,4.[6] Prosječna molekulska masa proteina procijenjena je na 60,531.748 Da, a koeficijent apsorpcije 25.440 M−1 cm−1.

CFAP157 se prvenstveno sastoji od α-heliksa, a ne postoji transmembranska spirala. Za kreiranje predviđene strukture CFAP157.Program za izradu strukture proteina koristi se program pod nazivom Phyre

Predviđena struktura CFAP157 prema Phyre-u

Homologija

Ne postoji poznati paralog za CFAP157 kod ljudi. CFAP157 ima brojne ortologe. Sljedeća tabela sadrži neke od ortologa, uključujući čovjeka, običnog čimpanzu, rezus-makaka, govedo, psa, miša, pacova, tropsku kandžastu žabu i zebricu.[7]

Vrsta Uobičajeno ime Pristupni broj Identitet sekvence Sličnost sekvence
Homo sapiens Čovjek NP_001012520 100% 100%
Pan troglodytes Obični čimpanza XP_001143084 98,5% 99,0%
Macaca mulatta Reus makak XP_001095281 95,2% 96,4%
Bos taurus Govedo XP_005213477 70,5% 84,0%
Canis lupus familiaris Pas XP_005625392 71,5% 80,9%
Mus musculus Miš NP_079895 64,6% 79,0%
Rattus norvegicus Pacov NP_001094339 64,2% 78,4%
Xenopus tropicalis Tropska kandžasta žaba NP_001072774 41,5% 60,5%
Danio rerio Zebrica NP_001103638 34,0% 54,9%

Interaktivni proteini

P14335 (Kunjin virus soj MRM61C) je virus koji stupa u interakciju s CFAP157 putem dvohibridnog pregleda. Kunjin virus nije tako ozbiljan kao drugi virusi, ali ovo je zapaženo otkriće jer je moguće iskoristiti interakciju za razvoj novih tipova lijekova. Istraživači sa Univerziteta u Queenslandu otkrili su novu medicinsku upotrebu virusa kunjin 2005. godine, a mogući tretmani uključuju vakcine protiv HIV-a/kancera.[8]

Reference

  1. ^ "CFAP157 - Cilia- and flagella-associated protein 157 - Homo sapiens (Human) - CFAP157 gene & protein". www.uniprot.org (jezik: engleski). Pristupljeno 5. 2. 2018.
  2. ^ a b Database, GeneCards Human Gene. "CFAP157 Gene - GeneCards | CF157 Protein | CF157 Antibody". www.genecards.org. Pristupljeno 20. 2. 2018.
  3. ^ a b "Homo sapiens cilia and flagella associated protein 157 (CFAP157), tran - Nucleotide - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
  4. ^ Group, Schuler. "EST Profile - Hs.652519". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
  5. ^ "cilia- and flagella-associated protein 157 [Homo sapiens] - Protein - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 20. 2. 2018.
  6. ^ "Prot pi | Bioinformatics Calculator". www.protpi.ch (jezik: engleski). Pristupljeno 23. 4. 2018.
  7. ^ "BLAST: Basic Local Alignment Search Tool". blast.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 23. 4. 2018.
  8. ^ "New medical uses for the Kunjin virus". News-Medical.net (jezik: engleski). 12. 4. 2005. Pristupljeno 6. 5. 2018.

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.