DOKUMEN123.COM

CCAT1
Identifikatori
Aliasi	CCAT1
Vanjski ID-jevi	OMIM: 617705 GeneCards: CCAT1
Ortolozi
	100507056
	n/a
	n/a
	n/a
	n; a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	n/a
	Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Transkript 1 pridružen raku debelog crijeva je dugolančana nekodirajuća RNK koja kod ljudi kodirana genom CCAT1.^[2]^[3]

Ovaj gen proizvodi dugolančanu nekodirajuću RNK koja podstiče stvaranje tumora i pojačano je regulirana u raku debelog crijeva i ćelijama drugih tipova raka.^[4] Ovaj transkript može regulirati hromosomske interakcije dugog dometa, uključujući i na lokusu Myc onkoproteina.^[5] Ova RNK može funkcionirati i kao molekulska spužva za mikroRNK-e.^[4]

Vitalne uloge dugolančanihih nekodirajućih RNK (incRNK) uključene su u sve veći broj studija o razvoju tumora. LncRNK CCAT1 prepoznata je kao povezana s razvojem tumora, ali njena veza s kolorektumskim karcinomom (CRC) ostaje nedokučiva. Jedno istraživanje imalo za cilj rasvijetliti funkciju i mehanizme duge nekodirajuće RNK CCAT1 u CRC-u. Iz skupa podataka lncRNK profila od 38 parova podudarnih tkiva debelog crijeva za kontrolu tumora pacijenata sa kolorektumskom terapijom smještenih u Atlasu genoma raka (TCGA), otkriveno je 10 reguliranih i 10 podregulitanih lncRNK u CRC-u. Pedeset slučajeva pacijenata s CRC -om bilo je uključeno radi analize korelacije između ekspresije CCAT1 i kliničke patologije. Inverzna korelacija ekspresije i ciljne veze između CCAT1 i miR181a-5p potvrđena je pomoću qRT-PCR i testa reporterskog gena s dvostrukom luciferazom.

Održivost ćelija, sposobnost formiranja kolonija, agresivnost i apoptoza određivani su MTT-testom, testom formiranja kolonija, Transwell testovima i analizama zacjeljivanja rana, te analizom protočne citometrije. Nadalje, korišten je model ksenotransplantata. za pokazivanje da obaranje CCAT1 inhibira rast tumora in vivo. Ekspresija lncRNK CCAT1 značajno je povećana u tkivima CRC-a. Ekspresija CCAT1 pozitivno je povezana sa stadijem raka (American Joint Committee on Cancer stage, p<0,05). CCAT1 je promovirao ćelijsku proliferaciju, rast i pokretljivost ciljajući miR-181a-5p, a utišanost CCAT1 povećala je učestalost apoptoza. Isti učinak primijećen je u in vivo modelu ksentranplantata, pri čemu su veličina tumora i protivtumorskih proteina značajno smanjeni nokdaunom CCAT1.^[6]

Reference

^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Entrez Gene: Colon cancer associated transcript 1 (non-protein coding)". Pristupljeno 16. 3. 2017.
^ "CCAT2 colon cancer associated transcript 2 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 13. 6. 2020.
^ ^a ^b "CCAT1 Gene - GeneCards | CCAT1 RNA Gene". www.genecards.org. Pristupljeno 29. 6. 2020.
^ "CCAT1 colon cancer associated transcript 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 29. 6. 2020.
^ Anquan Shang , Weiwei Wang , Chenzheng Gu, Wei Chen, Wenying Lu, Zujun Sun, Dong Li (2020): Long non-coding RNA CCAT1 promotes colorectal cancer progression by regulating miR-181a-5p expression. Aging (Albany NY), 12(9):8301-8320; pmid: 32380476; pmcid: pmc7244037; doi: 10.18632/aging.103139

Dopunska literatura

Yang F, Xue X, Bi J, Zheng L, Zhi K, Gu Y, Fang G (2013). "Long noncoding RNA CCAT1, which could be activated by c-Myc, promotes the progression of gastric carcinoma". J. Cancer Res. Clin. Oncol. 139 (3): 437–45. doi:10.1007/s00432-012-1324-x. PMID 23143645. S2CID 667876.
Alaiyan B, Ilyayev N, Stojadinovic A, Izadjoo M, Roistacher M, Pavlov V, Tzivin V, Halle D, Pan H, Trink B, Gure AO, Nissan A (2013). "Differential expression of colon cancer associated transcript1 (CCAT1) along the colonic adenoma-carcinoma sequence". BMC Cancer. 13: 196. doi:10.1186/1471-2407-13-196. PMC 3639026. PMID 23594791.
Xiang JF, Yin QF, Chen T, Zhang Y, Zhang XO, Wu Z, Zhang S, Wang HB, Ge J, Lu X, Yang L, Chen LL (2014). "Human colorectal cancer-specific CCAT1-L lncRNA regulates long-range chromatin interactions at the MYC locus". Cell Res. 24 (5): 513–31. doi:10.1038/cr.2014.35. PMC 4011346. PMID 24662484.
Luo J, Tang L, Zhang J, Ni J, Zhang HP, Zhang L, Xu JF, Zheng D (2014). "Long non-coding RNA CARLo-5 is a negative prognostic factor and exhibits tumor pro-oncogenic activity in non-small cell lung cancer". Tumour Biol. 35 (11): 11541–9. doi:10.1007/s13277-014-2442-7. PMID 25129441. S2CID 17249302.
Ma MZ, Chu BF, Zhang Y, Weng MZ, Qin YY, Gong W, Quan ZW (2015). "Long non-coding RNA CCAT1 promotes gallbladder cancer development via negative modulation of miRNA-218-5p". Cell Death Dis. 6: e1583. doi:10.1038/cddis.2014.541. PMC 4669740. PMID 25569100.
Zhang Y, Ma M, Liu W, Ding W, Yu H (2014). "Enhanced expression of long noncoding RNA CARLo-5 is associated with the development of gastric cancer". Int J Clin Exp Pathol. 7 (12): 8471–9. PMC 4314006. PMID 25674211.
Cabanski CR, White NM, Dang HX, Silva-Fisher JM, Rauck CE, Cicka D, Maher CA (2015). "Pan-cancer transcriptome analysis reveals long noncoding RNAs with conserved function". RNA Biol. 12 (6): 628–42. doi:10.1080/15476286.2015.1038012. PMC 4615893. PMID 25864709.
Deng L, Yang SB, Xu FF, Zhang JH (2015). "Long noncoding RNA CCAT1 promotes hepatocellular carcinoma progression by functioning as let-7 sponge". J. Exp. Clin. Cancer Res. 34: 18. doi:10.1186/s13046-015-0136-7. PMC 4339002. PMID 25884472.
Zhu H, Zhou X, Chang H, Li H, Liu F, Ma C, Lu J (2015). "CCAT1 promotes hepatocellular carcinoma cell proliferation and invasion". Int J Clin Exp Pathol. 8 (5): 5427–34. PMC 4503117. PMID 26191246.

[1] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[entrez-2] "Entrez Gene: Colon cancer associated transcript 1 (non-protein coding)". Pristupljeno 16. 3. 2017.

[3] "CCAT2 colon cancer associated transcript 2 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 13. 6. 2020.

[genecards.org-4] "CCAT1 Gene - GeneCards | CCAT1 RNA Gene". www.genecards.org. Pristupljeno 29. 6. 2020.

[5] "CCAT1 colon cancer associated transcript 1 [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov. Pristupljeno 29. 6. 2020.

[6] Anquan Shang , Weiwei Wang , Chenzheng Gu, Wei Chen, Wenying Lu, Zujun Sun, Dong Li (2020): Long non-coding RNA CCAT1 promotes colorectal cancer progression by regulating miR-181a-5p expression. Aging (Albany NY), 12(9):8301-8320; pmid: 32380476; pmcid: pmc7244037; doi: 10.18632/aging.103139

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

CCAT1

Reference

Dopunska literatura

Content Disclaimer