Pemilihan presiden diadakan di Filipina pada 11 Mei 1998. Dalam pemilihan presiden tersebut, Wakil PresidenJoseph Estrada memenangkan masa jabatan selama enam tahun sebagai Presiden oleh sebuah kemenangan longsor. Dalam persaingan jabatan waktu presiden, SenatorGloria Macapagal-Arroyo memenangkan enam masa jabatan sebagai Wakil Presiden juga oleh kemenangan longsor. Pemilihan tersebut merupakan pemilihan ketiga dimana presiden dan wakil presiden berasal dari partai yang berbeda.
