Ku80

X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining)
PDB rendering based on 1jeq.PDB rendering based on 1jeq.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB

1JEQ, 1JEY, 1Q2Z, 1RW2, 3RZ9

Идентификаторы
Символ XRCC5 ; KARP-1; KARP1; KU80; KUB2; Ku86; NFIV
Внешние ID OMIM: 194364 MGI: 104517 HomoloGene: 40681 GeneCards: Ген XRCC5
номер EC 3.6.1. EC 3.6.1.
Генная онтология
Функция • DNA binding

• damaged DNA binding
• double-stranded DNA binding
• double-stranded telomeric DNA binding
• ATP-dependent DNA helicase activity
• protein binding
• ATP binding
• protein C-terminus binding
• ubiquitin protein ligase binding
• telomeric DNA binding
• transcription regulatory region DNA binding
• poly(A) RNA binding

• 5'-deoxyribose-5-phosphate lyase activity
Компонент клетки • nuclear telomere cap complex

• nuclear chromosome, telomeric region
• nucleus
• nucleoplasm
• nucleolus
• cytosol
• plasma membrane
• membrane
• Ku70:Ku80 complex

• nonhomologous end joining complex
Биологический процесс • telomere maintenance

• DNA repair
• double-strand break repair
• double-strand break repair via nonhomologous end joining
• DNA recombination
• transcription, DNA-templated
• cell proliferation
• viral process
• positive regulation of type I interferon production
• DNA duplex unwinding
• innate immune response
• negative regulation of transcription, DNA-templated
• regulation of smooth muscle cell proliferation
• positive regulation of neurogenesis
• hematopoietic stem cell differentiation

• establishment of integrated proviral latency
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид Человек Мышь
Entrez 7520 22596
Ensembl ENSG00000079246 ENSMUSG00000026187
UniProt P13010 P27641
RefSeq (мРНК) NM_021141 NM_009533
RefSeq (белок) NP_066964 NP_033559
Локус (UCSC) Chr 2:
216.11 – 216.21 Mb		 Chr 1:
72.31 – 72.39 Mb
Поиск в PubMed Искать Искать

Ku80 — белок, закодированный у человека геном XRCC5.[1] Вместе с белком Ku70 белок Ku80 образует гетеродимер, связывающийся с концами двунитевых разрывов в ДНК, и требуется для репарации ДНК путём негомологичного соединения концов (NHEJ). Также белок Ku требуется для V(D)J рекомбинации, которая использует путь NHEJ для создания разнообразия антиген-связывающих центров антител в иммунной системе млекопитающих.

Также Ku требуется для поддержания длины теломер и сайленсинга прителомерных генов.[2]

Ku был впервые обнаружен у пациентов с системной красной волчанкой, у которых были выявлены высокие титры антител против этого белка.[1]

Ku80 имеет несколько других названий:

  • Ku аутоантиген, белок p80 волчанки
  • субъединица 2 АТР-зависимой ДНК-хеликазы 2
  • XRCC5 (англ. X-ray repair cross-complementing 5)

Клиническое значение

Редкий микросателлитный полиморфизм данного гена связан с опухолями у пациентов с различной чувствительностью к радиоактивности.[3]

Взаимодействия

Показаны белок-белковые взаимодействия Ku80 с NCOA6,[4][5] GCN5L2,[6] Ku70,[6][7][8][9][10] АТР-зависимой хеликазой синдрома Вернера,[11][12] Тирозин-киназой 2,[13] белком c-Abl в гомологичном киназе каталитическом участке ДНК-зависимой протеинкиназы,[14][15][7] TERF2IP,[16] обратной транскриптазой теломер,[17] POU2F1[18][15] и белком PCNA.[15][19][20]

Примечания

  1. ↑ 1 2 Entrez Gene: XRCC6 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 6 (Ku autoantigen, 70kDa).
  2. ↑ Boulton S.J., Jackson S.P. Components of the Ku-dependent non-homologous end-joining pathway are involved in telomeric length maintenance and telomeric silencing (англ.) // EMBO J. : journal. — 1998. — March (vol. 17, no. 6). — P. 1819—1828. — doi:10.1093/emboj/17.6.1819. — PMID 9501103. — PMC 1170529.
  3. ↑ Entrez Gene: XRCC5 X-ray repair complementing defective repair in Chinese hamster cells 5 (double-strand-break rejoining; Ku autoantigen, 80kDa). Архивировано 8 марта 2010 года.
  4. ↑ Ko, L; Cardona G R., Chin W W. Thyroid hormone receptor-binding protein, an LXXLL motif-containing protein, functions as a general coactivator (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — UNITED STATES, 2000. — May (vol. 97, no. 11). — P. 6212—6217. — ISSN 0027-8424. — PMID 10823961.
  5. ↑ Ko, Lan; Chin William W. Nuclear receptor coactivator thyroid hormone receptor-binding protein (TRBP) interacts with and stimulates its associated DNA-dependent protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2003. — March (vol. 278, no. 13). — P. 11471—11479. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M209723200. — PMID 12519782.
  6. ↑ 1 2 Barlev, N A; Poltoratsky V., Owen-Hughes T., Ying C., Liu L., Workman J L., Berger S L. Repression of GCN5 histone acetyltransferase activity via bromodomain-mediated binding and phosphorylation by the Ku-DNA-dependent protein kinase complex (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — UNITED STATES, 1998. — March (vol. 18, no. 3). — P. 1349—1358. — ISSN 0270-7306. — PMID 9488450.
  7. ↑ 1 2 Gell, D; Jackson S P. Mapping of protein-protein interactions within the DNA-dependent protein kinase complex (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — ENGLAND, 1999. — September (vol. 27, no. 17). — P. 3494—3502. — PMID 10446239.
  8. ↑ Yang, C R; Yeh S., Leskov K., Odegaard E., Hsu H L., Chang C., Kinsella T J., Chen D J., Boothman D A. Isolation of Ku70-binding proteins (KUBs) (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — ENGLAND, 1999. — May (vol. 27, no. 10). — P. 2165—2174. — ISSN 0305-1048. — PMID 10219089.
  9. ↑ Singleton, B K; Torres-Arzayus M I., Rottinghaus S T., Taccioli G E., Jeggo P A. The C terminus of Ku80 activates the DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (англ.) // Mol. Cell. Biol. : journal. — UNITED STATES, 1999. — May (vol. 19, no. 5). — P. 3267—3277. — ISSN 0270-7306. — PMID 10207052.
  10. ↑ Song, K; Jung D., Jung Y., Lee S G., Lee I. Interaction of human Ku70 with TRF2 (англ.) // FEBS Lett.[англ.] : journal. — NETHERLANDS, 2000. — September (vol. 481, no. 1). — P. 81—5. — ISSN 0014-5793. — PMID 10984620.
  11. ↑ Karmakar, Parimal; Snowden Carey M., Ramsden Dale A., Bohr Vilhelm A. Ku heterodimer binds to both ends of the Werner protein and functional interaction occurs at the Werner N-terminus (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — England, 2002. — August (vol. 30, no. 16). — P. 3583—3591. — PMID 12177300.
  12. ↑ Li, B; Comai L. Functional interaction between Ku and the werner syndrome protein in DNA end processing (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 2000. — September (vol. 275, no. 37). — P. 28349—28352. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.C000289200. — PMID 10880505.
  13. ↑ Adam, L; Bandyopadhyay D., Kumar R. Interferon-alpha signaling promotes nucleus-to-cytoplasmic redistribution of p95Vav, and formation of a multisubunit complex involving Vav, Ku80, and Tyk2 (англ.) // Biochem. Biophys. Res. Commun. : journal. — UNITED STATES, 2000. — January (vol. 267, no. 3). — P. 692—696. — ISSN 0006-291X. — doi:10.1006/bbrc.1999.1978. — PMID 10673353.
  14. ↑ Jin, S; Kharbanda S., Mayer B., Kufe D., Weaver D T. Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 1997. — October (vol. 272, no. 40). — P. 24763—24766. — ISSN 0021-9258. — PMID 9312071.
  15. ↑ 1 2 3 Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T., Price Gerald B., Zannis-Hadjopoulos Maria. Ku antigen, an origin-specific binding protein that associates with replication proteins, is required for mammalian DNA replication (англ.) // Biochim. Biophys. Acta[англ.] : journal. — Netherlands, 2002. — October (vol. 1578, no. 1—3). — P. 59—72. — ISSN 0006-3002. — PMID 12393188.
  16. ↑ O'Connor, Matthew S; Safari Amin, Liu Dan, Qin Jun, Songyang Zhou. The human Rap1 protein complex and modulation of telomere length (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2004. — July (vol. 279, no. 27). — P. 28585—28591. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M312913200. — PMID 15100233.
  17. ↑ Chai, Weihang; Ford Lance P., Lenertz Lisa, Wright Woodring E., Shay Jerry W. Human Ku70/80 associates physically with telomerase through interaction with hTERT (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — December (vol. 277, no. 49). — P. 47242—47247. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M208542200. — PMID 12377759.
  18. ↑ Schild-Poulter, C; Pope L., Giffin W., Kochan J C., Ngsee J K., Traykova-Andonova M., Haché R J. The binding of Ku antigen to homeodomain proteins promotes their phosphorylation by DNA-dependent protein kinase (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2001. — May (vol. 276, no. 20). — P. 16848—16856. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M100768200. — PMID 11279128.
  19. ↑ Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi, Sugimoto Katsunori, Obuse Chikashi, Tsurimoto Toshiki. A proteomics approach to identify proliferating cell nuclear antigen (PCNA)-binding proteins in human cell lysates. Identification of the human CHL12/RFCs2-5 complex as a novel PCNA-binding protein (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2002. — October (vol. 277, no. 43). — P. 40362—40367. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M206194200. — PMID 12171929.
  20. ↑ Balajee, A S; Geard C R. Chromatin-bound PCNA complex formation triggered by DNA damage occurs independent of the ATM gene product in human cells (англ.) // Nucleic Acids Res. : journal. — England, 2001. — March (vol. 29, no. 6). — P. 1341—1351. — PMID 11239001.

Литература

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.