SAMドメイン （英 : sterile alpha motif domain ）は、多様な真核生物 のタンパク質 に存在する約70残基のドメイン であり[ 1] タンパク質間相互作用 モジュールである[ 2] 結合定数 は低いものの他のさまざまなSAMドメイン非含有タンパク質とも結合する[ 3] [ 4]
SAMドメインはRNA 結合能も有するようである[ 5] ショウジョウバエ 胚でモルフォゲン 勾配の確立を補助するタンパク質であるSmaug （英語版 ） Nanos のmRNA の3' UTR に存在する2つの類似したヘアピン構造に結合することで、その翻訳 を抑制する。SmaugのRNA結合領域の結晶構造ではSmaugのSAMドメイン上に正に帯電した残基のクラスターが存在することが示されており、この領域がRNA結合面となっている可能性がある。こうした正の電位はこれまで決定されたSAMドメイン構造の中で独特なものであり、またSmaugのホモログ間で保存されている。こうした結果は、このSAMドメインの主要な役割がRNA結合である可能性を示唆している。
SAMドメインの構造解析により、小さな5本のヘリックスバンドル が2つの大きな相互作用面を形成するように配置されていることが示されている[ 3] EPHB2 （英語版 ） [ 4]
Ste50pは、主に菌類 やその他一部の真核生物にみられるタンパク質である。菌類のSte50pは、外部刺激への応答、より具体的は接合 、細胞成長、浸透圧 耐性[ 6] MAPK カスケードに関与している。
Ste50pは接合のためのフェロモン の検知に関与している。Ste50pはSte11pに結合し、フェロモンによって誘導されるシグナル伝達応答を延長することが知られている。さらに、窒素 枯渇への応答の補助にも関与している[ 7]
菌類のSte50pのSAMドメインは6本のヘリックスからなり、これらはコンパクトな球状のフォールドを形成している。溶液中では単量体であるが、ヘテロ二量体化（一部の場合にはオリゴマー化）が生じることが多い[ 7]
Ste50pのSAMドメインは、Ste11pのSAMドメインと相互作用することが多い。一方のタンパク質のSAMドメインが他方のタンパク質のSAMドメインに結合することは重要であり、in vitro では自己結合は生じない[ 7] In vivo では、Ste50pのオリゴマー化が生じている証拠が多く得られている[ 8] [ 9]
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