1872年に、鳥類の分類学の発展に貢献した著書、"Key to North American Birds" を発表し、1884年、1891年に改訂版を
出版した。1873年から1876年の間、フェルディナンド・ヴァンデヴィア・ヘイデンが率いた、アメリカ北部の開拓地域の科学調査に医師、博物学者として参加した。1874年に"Birds of the North-west"、1878年に"Birds of the Colorado Valley" を出版した。1877年に哺乳類の分野でも、"North American Rodentia" を出版した。1876年から1880年の間、政府の地質調査、地理調査の事務局を務め、1877年からコロンビア大学の医学校で解剖学を教え始めた。
1881年に研究と著作に専念するために軍を退役し、1882年にコロンビア大学の解剖学の教授に任じられた。1833年にアメリカ鳥学会の創立者の一人となり、会誌 The Aukなどの出版の責任者となった。
1880年に神智学協会のヘンリー・スティール・オルコットと知り合い、神智学協会で活動し、その後、ワシントン・グノーシス主義神学会(Gnostic Theosophical Society of Washington)を設立し、1890年にはアメリカ無神論的神智学会(Esoteric Theosophical Society of America)を設立し会長になった。
著書の図版
"Key to North American birds" の図版
著作
1861 : A monograph of the Tringeae of North America2 (Philadelphie).
1873 : A check list of North American birds3 (Naturalists' agency, Salem).
1874 : Field ornithology. Comprising a manual of instruction for procuring, preparing and preserving birds, and a check list of North American birds4 (Naturalists' agency, Salem).
1874 : Birds of the North-west
1877 : Monographs on North American Rodentia, avec Joel Asaph Allen
1878 : Birds of the Colorado Valley... scientific and popular information concerning North American ornithology5 (Gov’t print, Washington).
1878-1880 : A Bibliography of Ornithology (incomplet).
1879 : A check list of North American birds6 (F.W. Putnam, Salem).
1881-1883 : Winfrid Alden Stearns (1852-1909)と共著, New England bird life: being a manual of New England ornithology7 (Lee and Shepard, Boston ; C.T. Dillingham, New York).
1882 : The Coues check list of North American birds8 (Estes and Lauriat, Boston).
1884 : Biogen, A Speculation on the Origin and Motive of Life
1884 : The Daemon of Darwin
1886 : Can Matter Think ?
1887 : Neuro-Myology
参考文献
Daniel Giraud Elliot (1901). In Memoriam : Elliott Coues, Auk (The), 18, 1 : 1-11.
Barbara Mearns et Richard Mearns (1988). Biographies for Birdwatchers: The Lives of Those Commemorated in Western Palearctic Bird Names, Academic Press (Londres) : 490 p.