DAS Konoweha berbentuk memanjang dengan luas mencapai 6.978,41 km2. Terdapat tiga kabupaten dan satu kota yang mencangkup DAS ini yaitu Kabupaten Kolaka Timur, Kabupaten Konawe Selatan, Kabupaten Konawe, dan Kota Kendari. Hulu sungai ini berupa pegunungan dengan kemiringan terjal sedangkan bagian tengah berupa dataran rendah berawa-rawa sehingga alur sungai berkelak-kelok dan berubah-ubah. Anak sungainya meliputi: