Pada tahun 1858, di dalam Proceedings of the Linnean Society, Sclater membentuk enam daerah geografis hewan yang olehnya dinamakan Palaearctic, Aethiopian, India, Australasia, Nearctic dan Neotropical. Daerah geografis ini masih digunakan sampai sekarang. Sclater juga mengembangkan teori Lemuria pada tahun 1864, yang isinya menjelaskan hubungan antara hewan-hewan di Madagaskar dan India.
Di antara buku-buku penting hasil karya Sclater adalah Exotic Ornithology yang diterbitkan antara tahun 1866-1869 dan Nomenclator Avium yang diterbitkan pada tahun 1873. Kedua buku ini dibuat bersama dengan Osbert Salvin. Buku Argentine Ornithology pada tahun 1888-1889 dengan W.H. Hudson, dan buku The Book of Antelopes antara tahun 1894-1900 yang dibuat bersama dengan Oldfield Thomas.
Anak laki-lakinya yang bernama William Lutley Sclater, juga adalah seorang ahli ilmu burung.
Philip Lutley Sclater meninggal dunia pada tanggal 27 Juni1913.