Pada tahun 1609, penjelajah Inggris Henry Hudson yang berada di kapal milik VOCHalve Maen tiba di dekat sungai yang kelak dinamai menurut namanya, dalam pencarian jalan tembus menuju Asia. Di tempat yang kini bernama Kinderhook, ia harus memutar balik karena sungai itu terlalu sempit dilayari. Ia menamai daerah itu Kinderhoeck, dan keinginan mengkolonisasi menciptakan perang dengan penduduk asli. Pada tahun 1640 para kolonis Belanda pertama mendirikan permukiman di situ. Setelah orang Belanda, kolonis Britania dan suku Indian Mohican tiba kemudian pada abad ke-17 dan berebutan permukiman itu. Kota Kinderhook didirikan pada tahun 1788. Kota ini dibentuk dari distrik yang sebelumnya dibentuk (1772), tetapi distrik ini kehilangan beberapa wilayahnya untuk membentuk bagian Kota Chatham pada tahun 1775. Kinderhook adalah salah satu kota awal Columbia County. Banyak wilayah Kinderhook yang hilang untuk membentuk Kota Ghent pada tahun 1818 dan Kota Stuyvesant pada tahun 1823. Di desa itu, tak sampai dalam jangka masa yang panjang, telah banyak penghuninya, kebanyakan berasal dari Belanda.
Trivia
Nama julukan Martin Van Buren adalah Old Kinderhook, menurut salah satu teori terkenal menjadi asal singkatan bagi O.K. yang dalam bahasa Indonesia biasa dilafalkan oke.
Tokoh dari Kinderhook
Martin Van Buren (1782-1862), presiden ke-8 Amerika Serikat (juga meninggal di Kinderhook)
Hannah Van Buren (1783-1819), terlahir Hannah Hoes, adalah istri Martin Van Buren
Daerah di sekitarnya
Di bawah ini adalah daerah-daerah yang terletak dalam radius 12 km dari Kinderhook.