Johann Anton Graf von Pergen (15 Februari 1725 di Wina - 12 Mei 1814 juga di kota Wina) adalah seorang diplomat dan negarawan di pemerintahan Monarki Habsburg. Ia mengabdi untuk empat penguasa monarki selama lebih dari lima puluh tahun. Ia juga merupakan salah satu tokoh yang paling berpengaruh di dalam pemerintahan reformis Kaisar Joseph II (1780-1790).
Sebagai menteri negara, beberapa pencapaiannya adalah modernisasi pendidikan tinggi dan penindasan pengaruh keuskupan. Ia juga bertanggung jawab atas pendirian organisasi polisi baru yang menjalankan gagasan-gagasan radikal Joseph. Ia juga membina satuan polisi rahasia yang akan membungkam oposisi. Walaupun akhirnya digantikan oleh Joseph Sonnenfels pada masa Kaisar Leopold VII (1790-1792), ia kembali ditugaskan untuk menindas oposisi pada masa Kaisar Franz II (1792-1835).